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伴隨診斷及其對(duì)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)的影響

發(fā)布時(shí)間:2014-12-30 15:17:12     來(lái)源:檢驗(yàn)世界網(wǎng)     點(diǎn)擊量:

Vijay Modur博士在2014AACC年會(huì)上進(jìn)行了“Companion Diagnostics and Their Impact on Laboratory Medicine: A Glimpse of The Future”主題報(bào)告,Modur博士分析伴隨診斷變得重要的原因,總結(jié)技術(shù)和療法的進(jìn)步,闡述基于證據(jù)的檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)在藥物開(kāi)發(fā)創(chuàng)新的診斷作用,說(shuō)明新藥物研發(fā)的患者選擇導(dǎo)至新型診斷測(cè)試的開(kāi)發(fā)。

  在過(guò)去的十年中,一個(gè)主要的趨勢(shì)是開(kāi)發(fā)新興療法成為發(fā)展個(gè)體化用藥的主要途徑。那伴隨診斷為什么變得如此重要呢?在這篇文章里我們將對(duì)這個(gè)問(wèn)題進(jìn)行一些歷史展望以便更好地進(jìn)行將來(lái)的研究。

  一、伴隨診斷變得重要的原因
  以糖尿病為例(以下數(shù)據(jù)來(lái)自美國(guó)糖尿病協(xié)會(huì)),我們想要探究的是實(shí)驗(yàn)室測(cè)試與最終開(kāi)發(fā)療法之間的關(guān)系,以及療法是如何改變相應(yīng)時(shí)代的治療狀況的。只需要注意上世紀(jì)中葉是如何開(kāi)發(fā)糖尿病實(shí)驗(yàn)室測(cè)試,進(jìn)而由實(shí)驗(yàn)室測(cè)試收集的大量數(shù)據(jù)得出糖尿病治療的藥物需求,就可以從中了解糖尿病治療,以及藥物的研發(fā)歷史(見(jiàn)表1)?,F(xiàn)在人們已經(jīng)對(duì)糖尿病的發(fā)病頻率,以及如何治療糖尿病有了充分的了解。所有這些促使了Banting和Best發(fā)現(xiàn)胰島素,不久以后,從動(dòng)物的胰腺提純的胰島素出現(xiàn),并用于糖尿病的治療。這就是實(shí)驗(yàn)室測(cè)試為什么如此重要的原因。


  其他一些疾病也有類似的過(guò)程。從疾病的局部初始診斷,到研發(fā)出相應(yīng)的療法,這之間以前基本上需要50年或更長(zhǎng)。世人熟知Framingham的心臟病研究,這個(gè)研究發(fā)現(xiàn)膽固醇是心臟疾病的一個(gè)主要促進(jìn)因素。從發(fā)現(xiàn)膽固醇到把膽固醇指標(biāo)作為心臟病的診斷指標(biāo),再到發(fā)明他汀類藥物對(duì)誘發(fā)心臟疾病的膽固醇影響進(jìn)行治療,這個(gè)過(guò)程要明顯短于糖尿病-胰島素這個(gè)過(guò)程。同樣,艾滋病(HIV)-齊多夫定,丙型肝炎(HCV)-干擾素,以及非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)-克里唑蒂尼才用了5年,這個(gè)過(guò)程被一再縮短(圖1)。從這些事實(shí)可以得出,實(shí)驗(yàn)室測(cè)試發(fā)生創(chuàng)新緊接著就是新興療法的革新。實(shí)驗(yàn)室測(cè)試的革新和新興療法的革新發(fā)生地越來(lái)越快,它們是同時(shí)發(fā)展進(jìn)步的。臨床化學(xué)和臨床實(shí)驗(yàn)室需要了解的很重要的一點(diǎn)是:新興療法的發(fā)展方向及其產(chǎn)生的影響是什么。


二、技術(shù)和療法的進(jìn)步
緊跟時(shí)代和技術(shù)迅速發(fā)展的潮流,每天都有新的器械和技術(shù)出現(xiàn),如可以使某些測(cè)量工作與前幾年相比變得更準(zhǔn)確,更經(jīng)濟(jì),更迅速的技術(shù)。知識(shí)呈現(xiàn)爆炸性增長(zhǎng),我們發(fā)現(xiàn)自己被龐大信息量所吞沒(méi)。人類基因組計(jì)劃,以及該計(jì)劃的分支對(duì)新興療法的開(kāi)發(fā)提出了新的目標(biāo)。而且這兩者也在迅速的發(fā)展之中。測(cè)量DNA的技術(shù)以及DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展令人十分驚奇。我們可以經(jīng)常聽(tīng)到下一代測(cè)序和新生兒測(cè)序等技術(shù),實(shí)際上,下一代測(cè)序是一項(xiàng)新技術(shù),第一種這樣的設(shè)備已經(jīng)用于實(shí)驗(yàn)室研究,在進(jìn)行體外診斷之前,完成對(duì)某些疾病的初步診斷。


  歷史上曾出現(xiàn)過(guò)這樣的快速發(fā)展,在微生物學(xué)領(lǐng)域,對(duì)HIV的測(cè)試的發(fā)展就是明顯的例子,現(xiàn)在我們又有了其他的病毒測(cè)試板可供選擇,檢測(cè)同種病毒的可選測(cè)試板也增多了(圖3)。大量的新興技術(shù)正在出現(xiàn),對(duì)這些技術(shù)加以利用可以明顯改善和促進(jìn)療法的研究和開(kāi)發(fā)進(jìn)程。


  技術(shù)的發(fā)展激發(fā)了期望的膨脹,許多期望不切實(shí)際,通過(guò)醒悟階段,回歸復(fù)蘇期再到穩(wěn)定產(chǎn)能高峰期,這個(gè)曲線會(huì)很大程度上對(duì)臨床實(shí)驗(yàn)室產(chǎn)生影響。如果先前花費(fèi)5-10年甚至更長(zhǎng)開(kāi)發(fā)一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)室測(cè)試,那么現(xiàn)在僅需耗時(shí)幾個(gè)月就能開(kāi)發(fā)一項(xiàng)新測(cè)試。這不僅僅發(fā)生在實(shí)驗(yàn)室內(nèi),從事相關(guān)研究的大學(xué)以及商業(yè)研發(fā)公司內(nèi)無(wú)時(shí)無(wú)刻不在發(fā)生這樣的變化。


  現(xiàn)在,我們要關(guān)注一下療法是如何開(kāi)發(fā)的,療法的目標(biāo)是什么以及它對(duì)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)將會(huì)產(chǎn)生什么影響。以伊馬替尼為例(圖4),伊馬替尼是靶向療法的先驅(qū)。柱狀圖顯示伊馬替尼是如何在腫瘤部位實(shí)施靶向治療,以及在非腫瘤區(qū)域是如何發(fā)揮作用的。60年代,基因?qū)W有了長(zhǎng)足進(jìn)步,分析出慢性髓細(xì)胞性白血病(CML)的病因是:CML 9號(hào)染色體長(zhǎng)臂C-ABL原癌基因易位至22號(hào)染色體長(zhǎng)臂的斷裂點(diǎn)簇集區(qū)(BCR)形成BCR-ABL融合基因。融合基因?qū)е羈cr-abl,bcr-abl組成激酶,當(dāng)激酶被激活,就能導(dǎo)至慢性髓細(xì)胞性白血病(CML)。因此,抑制bcr-abl就有可能抑制疾病的產(chǎn)生和發(fā)展。在過(guò)去的5年中,如果能及早地明確這個(gè)原因進(jìn)行治療,患者就很有可能治愈。


  當(dāng)對(duì)靶向療法進(jìn)行測(cè)試的時(shí)候會(huì)發(fā)生什么呢?當(dāng)使用藥物的時(shí)候,需要在進(jìn)入人體前進(jìn)行臨床前試驗(yàn)。藥物在進(jìn)入人體前,需面臨兩項(xiàng)挑戰(zhàn):第一:正確的劑量是什么,在個(gè)體化用藥時(shí)會(huì)不會(huì)發(fā)生藥物過(guò)早分解?個(gè)體化用藥成功的關(guān)鍵點(diǎn)是使用正確的劑量對(duì)患者進(jìn)行治療;第二,如何選擇正確的患者?當(dāng)這兩項(xiàng)挑戰(zhàn)一而再再而三地重復(fù)出現(xiàn)時(shí),會(huì)導(dǎo)至兩個(gè)問(wèn)題:1 藥物是否作用于目標(biāo)? 2 是否對(duì)正確的患者進(jìn)行了治療?這些問(wèn)題今天已經(jīng)由基于證據(jù)的檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)進(jìn)行了解答。這就是在早期的藥物開(kāi)發(fā)過(guò)程,個(gè)體化用藥和個(gè)體化用藥方法的起源,現(xiàn)在的藥物則和診斷緊密相聯(lián)。


  三、基于證據(jù)的檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)在藥物開(kāi)發(fā)中創(chuàng)立新的診斷工具

  這就是如何創(chuàng)立新的診斷工具的方法,接下來(lái)我們要通過(guò)范例了解這個(gè)過(guò)程在過(guò)去是如何進(jìn)行的,以及對(duì)未來(lái)的一些展望。如果將基于證據(jù)的檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)作為開(kāi)發(fā)一種新試驗(yàn)的第一步,我們就要經(jīng)歷這一步,我們需要知道這個(gè)試驗(yàn)的基本特征,樣品類型,時(shí)間和樣品處理來(lái)建立試驗(yàn)的有效性,接著了解臨床前和臨床環(huán)境數(shù)據(jù),生成臨床信息以及如何解析患者試驗(yàn)數(shù)據(jù)。當(dāng)觀察藥物的開(kāi)發(fā)過(guò)程時(shí),這項(xiàng)工作在階段I之前,在生成一個(gè)金字塔形之前非常適用(圖5)。尤其是尚在進(jìn)行大量的動(dòng)物試驗(yàn)的時(shí)期,這項(xiàng)工作能提供試驗(yàn)發(fā)揮作用的原理證據(jù)和模擬系統(tǒng)中試驗(yàn)的最佳性能特點(diǎn)。接下來(lái)我們可以在階段I/II的臨床試驗(yàn)中,在臨床前和臨床環(huán)境中生成數(shù)據(jù),接著在階段II/III或階段III后期臨床解析中生成數(shù)據(jù)。所有這些就是基于證據(jù)的,藥物開(kāi)發(fā)的邏輯步驟。


  請(qǐng)看這個(gè)比較早的例子(圖6):這是阿侖膦酸鈉和二膦酸鹽相比,阿侖膦酸鈉用于預(yù)防骨軟骨病。阿侖膦酸鈉基于二膦酸鹽,作用于破骨細(xì)胞。抑制破骨細(xì)胞破壞骨骼,保護(hù)骨骼免受損傷。當(dāng)開(kāi)發(fā)阿侖膦酸鈉的時(shí)候,出現(xiàn)了一個(gè)大問(wèn)題。先前的療法,在先前療法的基礎(chǔ)上,阿侖膦酸鈉產(chǎn)生前骨再吸收抑制劑,膦酸鹽導(dǎo)至了骨軟化,這與預(yù)期的效果完全相反。這是不可接受的,不能讓藥物導(dǎo)至骨軟骨病。當(dāng)開(kāi)發(fā)阿侖膦酸鈉,研發(fā)人員了解其優(yōu)于先前的藥物,但重要的是如何顯示更佳的療效呢。所以在阿侖膦酸鈉的開(kāi)發(fā)期間,藥物研發(fā)團(tuán)隊(duì)不得不通過(guò)多種方法展示阿侖膦酸鈉具有增加骨密度的功效。他們的所作所為其實(shí)是實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的工作,指標(biāo)是uNTx和肌酸酐率。試驗(yàn)的原理是:如果在羥脯氨酸交聯(lián)的交鏈末端使用端肽,在端肽的一端測(cè)量羥脯氨酸交鏈。這是一項(xiàng)uNTx試驗(yàn)。當(dāng)在臨床試驗(yàn)中對(duì)阿侖膦酸鈉使用uNTx試驗(yàn)時(shí),看底線百分比的改變情況。在安慰劑試驗(yàn)中,uNTx的水平改變并不大。當(dāng)使用阿侖膦酸鈉后,uNTx的水平降低了,說(shuō)明骨骼不再被吸收。將這些數(shù)據(jù)與骨骼密度數(shù)據(jù)聯(lián)合使用,就能體現(xiàn)藥物的作用。在以前這是用于藥物開(kāi)發(fā)的試驗(yàn),現(xiàn)在則用于臨床試驗(yàn)。


  uNTx臨床應(yīng)用,使用芳香酶抑制劑治療的乳腺癌患者的骨密度(BMD結(jié)果)。骨密度高的患者有三種類型:骨骼密度極低的患者,醫(yī)師需要開(kāi)始使用阿侖膦酸鈉或增加劑量,骨密度適中的患者,醫(yī)師需要測(cè)量NTx,根據(jù)NTx水平?jīng)Q定是否使用阿侖膦酸鈉或者其他藥物,還有許多其他類的阿侖膦酸鈉藥物。這就是一個(gè)以前用于藥物研發(fā)而現(xiàn)在卻用于臨床的試驗(yàn)的范例。

  回到BCR-ABL的話題,因?yàn)檫@是一個(gè)頗具挑戰(zhàn)性的話題。作者花費(fèi)大量的時(shí)間對(duì)其進(jìn)行研究。許多和患有CML患者相關(guān)的試驗(yàn),當(dāng)然,對(duì)這些患者也進(jìn)行基因?qū)W試驗(yàn)。血液中的Bcr-abl的轉(zhuǎn)錄本水平,是這種疾病的疾病負(fù)擔(dān)的良好指標(biāo)。對(duì)疾病負(fù)擔(dān)進(jìn)行監(jiān)視,能夠得出患者是否對(duì)療法有反應(yīng)。我們對(duì)bcr-abl做出的任何處置可以視為使其通過(guò)臨床試驗(yàn)的活動(dòng),使其與探究性的生物標(biāo)志物融合。在這項(xiàng)試驗(yàn)中,我們每隔3-6個(gè)月對(duì)參與試驗(yàn)的每個(gè)患者進(jìn)行了采血,適于進(jìn)行bcr-abl監(jiān)視(圖7)。我們發(fā)現(xiàn)患者的bcr-abl水平可用于測(cè)定患者反應(yīng)。這是每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都可能進(jìn)行的商業(yè)試驗(yàn)之一。


  這項(xiàng)實(shí)驗(yàn)?zāi)軌虺蔀樯虡I(yè)性試驗(yàn)的證據(jù)是24個(gè)月的跟蹤隨訪信息。如果患者的bcr-abl比率小于0.1,他們將會(huì)有非常好的預(yù)后。如果bcr-abl率高于0.1,那么這個(gè)比率越高,預(yù)后就會(huì)越差。這個(gè)測(cè)試當(dāng)今在臨床領(lǐng)域的應(yīng)用是在:一年內(nèi),bcr-abl率未達(dá)到0.1以下或者比0.1更高的患者。這些患者必須使用有效的bcr-abl抑制劑。

  表2為從生物標(biāo)志物發(fā)展而來(lái)并用于臨床試驗(yàn)的診斷測(cè)試,這些大都為不同的藥物試驗(yàn)得來(lái)的診斷范例,接著我們通過(guò)給出的不同監(jiān)視試驗(yàn)的范例討論的是什么形成了伴隨診斷。


  四、新藥物研發(fā)的患者選擇導(dǎo)至新型診斷測(cè)試的開(kāi)發(fā)
  藥物開(kāi)發(fā)中的第二個(gè)最重要的問(wèn)題就是患者的選擇。在這個(gè)范例中,首先討論的是癌癥。癌癥治療面臨的問(wèn)題是患者目標(biāo)療法的鑒別是很復(fù)雜的。這是一個(gè)黑色素瘤(圖8),如果仔細(xì)觀察小視圖中的黑色素瘤,好多人都會(huì)說(shuō):“嘿,我有這種突變,應(yīng)該用這種方法治療!”于是活組織檢查被送交到測(cè)序試驗(yàn)。根據(jù)黑色素瘤類型的不同確定不同的療法。對(duì)于罕見(jiàn)的黑色素瘤,罕見(jiàn)類型所占的比例大概為5%,就不能按照常見(jiàn)類型的療法進(jìn)行治療。如果按照常見(jiàn)類型的療法對(duì)患者進(jìn)行治療,就會(huì)產(chǎn)生用藥錯(cuò)誤。因此我們進(jìn)行小鼠雜交瘤細(xì)胞試驗(yàn)(BRAF),確定BRAF突變要求的患者選擇。


  抗BRAF的第一種藥物被證明是維羅非尼,當(dāng)其在患者中應(yīng)用對(duì)抗BRAF 突變時(shí),也用于與達(dá)卡巴嗪做比較(圖9)。作為BRAF的抑制劑,其非常地有效。使用靶向療法的一個(gè)問(wèn)題是,隨著時(shí)間的推移,患者對(duì)這種療法會(huì)產(chǎn)生抗性。產(chǎn)生抗性對(duì)于藥品的開(kāi)發(fā)是一個(gè)機(jī)會(huì)。因?yàn)槌霈F(xiàn)抗藥性意味著出現(xiàn)了新的突變。對(duì)于出現(xiàn)了抗藥性的患者可采用二線或三線的抑制劑繼續(xù)治療。患者對(duì)療法產(chǎn)生反應(yīng),緊接著就是藥物的快速發(fā)展,這與伴隨診斷并不矛盾。

  通過(guò)簡(jiǎn)單的例子展示藥物與診斷之間的反饋環(huán)(表3),許多類型的實(shí)驗(yàn)室測(cè)試,可以是藥物開(kāi)發(fā)的一部分,或者促進(jìn)藥物的開(kāi)發(fā)。以已給出的疾病監(jiān)視試驗(yàn)為例:其可以使患者受益,亦可使新興療法的開(kāi)發(fā)受益??顾幮詷?biāo)志物對(duì)療法的切換有益,當(dāng)然大多數(shù)人已經(jīng)具有藥物抗藥性標(biāo)志物監(jiān)視,這也對(duì)新興藥品的開(kāi)發(fā)有益。出于對(duì)藥物的安全性,有效性和適用性的考慮,藥物開(kāi)發(fā)對(duì)療法和抗藥性有要求。早期診斷已經(jīng)成為熱議的話題,許多異構(gòu)體疾病具有較長(zhǎng)潛伏期和發(fā)展期,需要在其癥狀顯露前好多年進(jìn)行早期診斷。Eli lilly公司致力于發(fā)展異構(gòu)體疾病藥物。但是診斷單位懷疑淀粉樣蛋白是否具有在早期診斷疾病的能力?,F(xiàn)在,受到藥物開(kāi)發(fā)的影響,大力推進(jìn)早期診斷測(cè)試成為一種潮流。

  通過(guò)新興療法的不斷發(fā)展,取得新的診斷方法。奠定基礎(chǔ)的是生物標(biāo)志物的效果。藥物的研發(fā)任重而道遠(yuǎn)。先要通過(guò)系統(tǒng)的生物標(biāo)志物途徑,得到正確的方法-患者選擇,劑量和計(jì)劃,進(jìn)行個(gè)體化用藥。接著是療法診斷工具,找到正確的患者,監(jiān)視療法的實(shí)施,通過(guò)抗藥性測(cè)試和其他實(shí)驗(yàn)室測(cè)試進(jìn)行預(yù)后和風(fēng)險(xiǎn)分類。

  當(dāng)藥物的開(kāi)發(fā)和新興診斷方法變得如此接近,周期如此之短的時(shí)候,診斷機(jī)會(huì)被分成了兩部分。一部分是伴隨診斷:藥物-診斷流程和組合對(duì)藥物的成功提出更多要求,要達(dá)到藥物-診斷市場(chǎng)準(zhǔn)入的目的,藥物開(kāi)發(fā)和診斷團(tuán)隊(duì)之間必須具有高度的協(xié)調(diào)性;另一部分是疾病標(biāo)志物:未發(fā)現(xiàn)的新型疾病子集,風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)和監(jiān)視以及基于證據(jù)的患者管理中的疾病標(biāo)志物輔助。