1. 硝酸纖維素膜(NC膜)

　　硝酸纖維素膜是蛋白印跡最廣泛使用的轉(zhuǎn)移介質(zhì)，對(duì)蛋白有很強(qiáng)的結(jié)合能力，而且適用于各種顯色方法，包括同位素，化學(xué)發(fā)光(Luminol類)、常規(guī)顯色、染色和熒光顯色;背景低，信噪比高。NC膜的使用也很簡(jiǎn)便，比如不需要甲醛預(yù)處理，只要在無離子水面浸潤(rùn)排出膜內(nèi)氣泡，再在電泳緩沖液中平衡幾分鐘就可以了;比如NC膜很容易封閉，也不需要特別嚴(yán)謹(jǐn)?shù)那逑礂l件。轉(zhuǎn)移到NC膜上的蛋白在合適的條件下可以穩(wěn)定保存很長(zhǎng)時(shí)間，不過要注意的是純的硝纖膜在比較脆，又容易卷，操作要小心，不適合用于需要多次重復(fù)清洗的用途——因?yàn)榻?jīng)不起多次“折磨”。選擇硝纖膜時(shí)要注意的是選擇合適的孔徑，通常20KD以上的大分子蛋白用0.45um孔徑的膜，小于20KD的話建議選擇0.2um的，如果小于7KD的話最好選擇0.1um的膜。另外還要注意選擇純的NC膜——混有含醋酸纖維(CM)的NC膜結(jié)合力會(huì)有所降低。另外提醒一句：由于NC膜上結(jié)合的蛋白會(huì)因?yàn)橐恍┤ノ蹌┒淮?，因此在封閉時(shí)最好使用較溫和的Tween20，而且濃度不要超過0.3%(據(jù)說0.05%效果最好)。

　　2. PVDF膜

　　PVDF膜比較貴，但是做WB的“殺手锏”。與硝酸纖維素膜相比，PVDF膜在蛋白質(zhì)截留能力，機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)相容性上都更優(yōu)越的性能(Pluskal,et al.,1986)。市售硝酸纖維素膜的典型結(jié)合量是80-100μg/cm2,而PVDF膜結(jié)合量是100-200μg/cm2(而結(jié)合強(qiáng)度PVDF比硝纖膜強(qiáng)6倍!)。但是PVDF膜最大的優(yōu)點(diǎn)不僅于此：更好的機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)耐受性使PVDF膜在各種染色應(yīng)用和多重免疫檢測(cè)中成為理想選擇;而且單個(gè)凝膠的泳道復(fù)本可用于多種目的，如考馬斯亮藍(lán)染色后切出條帶并進(jìn)行N-末端測(cè)序、蛋白消化/肽分離/內(nèi)部測(cè)序和免疫檢測(cè)(Kurien,et al.,2003)。特別是需要做N端蛋白測(cè)序，在相當(dāng)“嚴(yán)酷”的清洗條件下，當(dāng)尼龍或者硝纖膜已經(jīng)降解的情況下PVDF膜依然保持本色，笑傲江湖。所以PVDF也是要做蛋白測(cè)序的唯一選擇。PVDF膜同樣分0.45um和0.2um的，后者孔徑小，對(duì)小分子蛋白有較好的攔截吸附，背景可能會(huì)比前者稍高。